Der Beschwerdeausschuss Prüfung Ärzte Bayern (BA) ist paritätisch mit Vertretern der Kassenärztlichen Vereinigung Bayern (Ärztevertreter) und der Krankenkassen besetzt. Zusätzlich wird ein unparteiischer Vorsitzender eingesetzt.
Die Vertreter werden von den jeweiligen Krankenkassen und der Kassenärztlichen Vereinigung Bayerns berufen.
Die Prüfungsstelle Ärzte Bayern unterstützt den Beschwerdeausschuss bei der Erfüllung seiner Aufgaben organisatorisch.